仏日山円性寺（ぶつにちざんえんしょうじ）は栖本城跡の一部で、栖本郡代所跡に寛永14（1637）年の島原・天草一揆の後、代官鈴木重成により建立されました。
江戸時代には、知行（武士に与えられたほうび）33石をおさめ、幕末までは天草４ヶ本寺の１つとして存在しました。
さらに、キリシタン信者の改宗取締役だけでなく、戸籍調査、通行手形、福祉教育などの行政的性格もあわせ持つ寺として、宗教行政寺と呼ばれていました。
寺の開基（かいき）は、正保２（1645）年３代将軍家光の代です。
栖本郡代所跡は、現在の円性寺境内にあり、慶長８（1603）年から寛永15（1638）年までの35年間置かれ、天草三郡代所の１つでもありました。
■指定区分：市指定
■指定種別：史跡
■指定日：昭和51年１月10日
■地域：栖本
■所在地：栖本町湯舟原字本丸 円性寺